No.
Las microondas no usan “radiación térmica” para calentar los alimentos, usan microondas. Las microondas son radiación electromagnética (en una longitud de onda entre la luz infrarroja y las ondas de radio). Específicamente, la frecuencia para un horno de microondas es de aproximadamente 2.45 GHz. Esa frecuencia es absorbida por los enlaces de hidrógeno, lo que esencialmente hace que las moléculas de agua vibren. Como recordará de la clase de ciencias, la temperatura es la energía cinética promedio de las moléculas: las moléculas que vibran significan calor. Dado que es predominantemente agua la que se está calentando, la comida no se crujiente y puede secarse por mucho tiempo (el agua se evapora). También puede hacer que las cosas salpiquen o exploten cuando se formen burbujas de vapor dentro de los alimentos y se expandan (por lo que es peligroso colocar recipientes sellados).
El único peligro de los alimentos en el microondas es realmente el hecho de que puede estar caliente y presentar un peligro de quemaduras. Las microondas no son radiación ionizante (lo que la gente suele pensar cuando piensa en la radiación, del tipo que causa daño en el ADN y el cáncer, esto es más cerca del Wi-Fi y la TV). Por lo que vale la pena, la radiación ionizante real tampoco hace que las cosas sean radiactivas (y no hace calor). Es seguro usar radiación para esterilizar alimentos, por ejemplo, como lo hacen para el programa espacial.