¿Por qué la mayoría de los alimentos cocinados (pasta, filetes, carne asada, pizza, papas fritas, etc.) saben mejor cuando están frescos que cuando se los recalienta?

No siempre es el caso.
Considere una serie de guisos que están hechos de una mezcla de muchos ingredientes, por ejemplo, y que vienen con una sabrosa salsa. Estos pueden recalentarse mejor, ¡pero nunca en el microondas! y en realidad, a menudo se recomienda que los cocines el día anterior. Durante la noche, los sabores se mezclarán correctamente y se unirán de la mejor manera posible.
Pero eso es solo un ejemplo.
En cuanto al resto, muchas cosas se secarán o endurecerán o, por el contrario, perderán todo su crujido, cuando se vuelvan a calentar. Esa es la química de los alimentos.

Sin duda depende de la comida. La razón por la que sucede puede ser algunas cosas.
1. El método de recalentamiento es diferente. La cocción en microondas de la carne tiende a tener un impacto negativo en la textura en comparación con la cocción superior de la estufa.
2. A menudo intenta recalentar más rápido que el método de cocción original, por lo que usa temperaturas más altas, esto puede llevar a que se seque la carne.
3. Algunas características cambian con el tiempo, como absorber la humedad y volverse más sobrio. Esto no se deshacería por recalentamiento.
4. Cada vez que agrega calor, el agua se evapora. El recalentamiento pierde más porque lo está calentando por segunda vez.

¿Es esto cierto? Creo que muchos platos, especialmente guisos, sopas, curries y chiles, prueban mejor el segundo día cuando todas las especias tienen la oportunidad de mezclarse mejor.