¿Es seguro eliminar las cookies? ¿Por qué o por qué no?

Sí, es seguro, pero es probable que desee guardar algunos de ellos, lo que le evitará iniciar sesión en los sitios.

Tal vez una buena estrategia es configurar el navegador para que elimine las cookies al salir y agregar a las excepciones los sitios que las cookies le gustaría conservar. Esto se puede hacer en las opciones del navegador.