La invención del microondas es un concepto fantásticamente simple. Las microondas tienen una frecuencia que puede penetrar agua, grasa y moléculas de azúcar y excitarlas. Para que se excite una molécula, los electrones que “orbitan” alrededor del núcleo deben elevar los niveles de energía. Cuando esto ocurre, el átomo comienza a vibrar más rápido de lo normal. Cuando esto sucede en un vaso de agua, por ejemplo, todos los átomos que componen el agua comienzan a moverse y chocan entre sí y crean fricción. Cuando se crea la fricción, la energía se desprende en forma de calor.
Cómo ocurre el calor … 
Movimiento
Fricción
Calor
Entonces, si las microondas pueden excitar las moléculas de una sustancia y crear calor, ¿por qué no usarlas para cocinar? Y eso, es como funciona un microondas. 
Hay un dispositivo dentro del horno que es la fuente de la radiación de microondas llamada magnetrón . Las ondas que viajan a la cavidad del horno a través de la guía de ondas y el agitador de modo. Las olas penetran la comida y excitan las moléculas. ¡Esta es la razón por la cual la comida se calienta desde adentro hacia afuera! Porque las olas están literalmente creando calor en el nivel atómico de la comida que a su vez cocina el producto de adentro hacia afuera.
Pero si un microondas se cocina de adentro hacia afuera, ¿cómo es que a veces su comida está fría en el medio? Esto se debe a que, dependiendo de la cantidad de comida que desee calentar, las microondas no pueden penetrar completamente al centro. Por ejemplo, un plato de maíz. Digamos que calientas el maíz durante 3 minutos, pero aún puede estar en el centro. Si lo sacas y lo revuelves, permitiendo que el maíz frío llegue a la cima, las microondas podrán penetrar los átomos y excitarlos y generar calor. 
Entonces, ¿cómo es que si calientas un trozo de pizza en el microondas por un período de tiempo más largo que el necesario, solo se queman algunas partes de la pizza? Esto es causado por la idea de “puntos calientes”. Se forman puntos calientes porque un microondas es sinusoidal, por lo que tiene picos y valles. Debido a esto, las microondas no pueden excitar todos los átomos a la vez. Los resultados son puntos calientes y fríos en el microondas. La imagen de la derecha muestra cómo se ven las microondas en el microondas después de que han reflejado las paredes del horno durante un período de tiempo. Los picos y valles representan los puntos calientes y las áreas planas representan los puntos fríos. Esto ocurre porque los picos y valles tienen una intensidad más fuerte y excitan los átomos más rápidamente que los puntos planos.