Presumiblemente, no vas a comer el caparazón. Es probable que los huevos comprados directamente de las granjas tengan un poquito de pollo. Todo lo que tiene que hacer es lavar el caparazón antes de abrir el huevo.
Cuando compras huevos de una tienda de comestibles, esos huevos se han lavado y desinfectado, hasta el punto en que se eliminó la capa inhibidora natural de las bacterias (que también es la razón por la cual los huevos comprados en la tienda deben refrigerarse).