Si rodea el objeto que no desea calentar con metal, el metal evitará que la mayor parte de la energía de microondas llegue al objeto. Sin embargo, las microondas inducirán algo de corriente eléctrica en el metal, por lo que querrás que sea bastante pesado o que se caliente por sí mismo. Algo como un recipiente de acero inoxidable debería estar bien, pero dependiendo del tamaño, etc., es probable que el papel de aluminio adquiera algunos puntos calientes que se sobrecalientan, comienzan a chispear y crean todo tipo de emoción (y posiblemente dañe el microondas).
Y sí, está bien poner metal en un horno de microondas, siempre que sea lo suficientemente pesado como para resistir el calentamiento antes mencionado, y no tenga esquinas agudas. También debe ser bastante pequeño en comparación con el volumen interior del horno; de lo contrario, podría afectar al magnetrón (que genera las microondas).